依照衛生福利部疾病管制署「主要傳染途徑」分類：
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另有衛教資訊，請參閱衛生教育（衛教資訊）
| 登革熱 | 屈公病 | 瘧疾 |
| 日本腦炎 | 鼠疫 | 恙蟲病 |
| 西尼羅熱 | 地方性斑疹傷寒 | 流行性斑疹傷寒 |
| 萊姆病 | 黃熱病 | 茲卡病毒感染症 |
| 裂谷熱 | 發熱伴血小板減少綜合症 | 淋巴絲蟲病 |
| 嚴重特殊傳染性肺炎 | 新型A型流感 | 孩童多系統炎症徵候群（MIS-C） |
| 水痘併發症 | 嚴重急性呼吸道症候群 | 天花 |
| 中東呼吸症候群冠狀病毒感染症 | 結核病 | 先天性德國麻疹症候群 |
| 流行性腮腺炎 | 百日咳 | 流感併發重症 |
| 侵襲性b型嗜血桿菌感染症 | 侵襲性肺炎鏈球菌感染症 | 退伍軍人病 |
| Q熱 | 肺囊蟲肺炎 | 隱球菌症 |
| 多重抗藥性結核病 | 鸚鵡熱 | 麻疹 |
| 德國麻疹 | 白喉 | 流行性腦脊髓膜炎 |
| 漢他病毒症候群 | 肺炎黴漿菌感染症 |
| 急性病毒性B型肝炎 | 急性病毒性C型肝炎 | 急性病毒性D型肝炎 |
| 人類免疫缺乏病毒(愛滋病毒)感染 | 梅毒 | 先天性梅毒 |
| 淋病 |
| 狂犬病 | 福氏內格里阿米巴腦膜腦炎 | 拉薩熱 |
| 馬堡病毒出血熱 | 伊波拉病毒感染 | 類鼻疽 |
| 炭疽病 | 鉤端螺旋體病 | 兔熱病 |
| 疱疹B病毒感染症 | 疥瘡感染症 | 頭蝨感染症 |
| 破傷風 | 新生兒破傷風 | 亨德拉病毒感染症 |
| 漢生病 | 貓抓病 | 立百病毒感染症 |
| 猴痘 | 兒童急性嚴重不明原因肝炎 | 社區型MRSA |
| 棘狀阿米巴 | NDM-1腸道菌感染症 | CRE抗藥性檢測 |
| VISA/VRSA抗藥性檢測 |